近日，瑞典烏普薩拉大學(xué)聯(lián)合華大集團(tuán)旗下深圳華大生命科學(xué)研究院、華大基因智惠醫(yī)學(xué)研究院對(duì)1063例結(jié)直腸癌樣本進(jìn)行了全基因組及轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析，發(fā)現(xiàn)了一系列與癌癥不同階段相關(guān)的基因，并識(shí)別了結(jié)直腸癌關(guān)鍵預(yù)后因子，為結(jié)直腸癌的預(yù)防、治療及預(yù)后都提供了數(shù)據(jù)基礎(chǔ)，相關(guān)研究于8月7日發(fā)表于全球頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊《自然》（Nature）。這也是目前全球最大的結(jié)直腸癌多組學(xué)研究。

Nature官網(wǎng)截圖。

基因信息+臨床數(shù)據(jù)，雙劍合璧破解“癌癥密碼”

為了加深對(duì)結(jié)直腸癌發(fā)病機(jī)制的理解，識(shí)別驅(qū)動(dòng)事件并確定其預(yù)后特征，中瑞兩國(guó)科研團(tuán)隊(duì)針對(duì)瑞典知名癌癥樣本與數(shù)據(jù)庫U-CAN隊(duì)列中的1063例結(jié)直腸癌樣本進(jìn)行了全基因組和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析。1063例樣本中包括782例結(jié)腸癌和281例直腸癌，其中，21%（223例）為微衛(wèi)星不穩(wěn)定腫瘤（結(jié)直腸癌中的一種特定類型）。

從測(cè)序結(jié)果中，研究團(tuán)隊(duì)鑒定得到了96個(gè)顯著突變基因，其中有24個(gè)為新發(fā)現(xiàn)的潛在驅(qū)動(dòng)基因；另外，研究人員還發(fā)現(xiàn)，與WNT, EGFR 和 TGF-β 通路相關(guān)的驅(qū)動(dòng)基因，也與結(jié)直腸癌生存顯著相關(guān)。

不止如此，研究人員還利用突變時(shí)序分析，推導(dǎo)出了9個(gè)與癌癥發(fā)生早期事件相關(guān)的驅(qū)動(dòng)突變基因，和更傾向于在癌癥發(fā)生的后期階段出現(xiàn)的突變基因。這些發(fā)現(xiàn)為結(jié)直腸癌的早期檢測(cè)和靶向治療的開發(fā)提供了臨床研究策略，并揭示了與腫瘤后期侵襲和轉(zhuǎn)移相關(guān)的重要分子變化。

本次分析的結(jié)直腸癌樣本中，94%的病人有完整的5年臨床隨訪記錄，這也為研究人員更好地將基因數(shù)據(jù)與臨床數(shù)據(jù)進(jìn)行結(jié)合，破解“癌癥密碼”提供了可能。

既往對(duì)結(jié)直腸癌基因相關(guān)的研究主要集中在編碼區(qū)突變，但其實(shí)非編碼區(qū)也可能會(huì)對(duì)癌癥發(fā)生發(fā)展造成影響。

本研究中，研究人員通過全基因組和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析，發(fā)現(xiàn)在線粒體基因組和非編碼區(qū)域中也存在與疾病相關(guān)的突變，并對(duì)與疾病進(jìn)展顯著相關(guān)的突變進(jìn)行了系統(tǒng)性的總結(jié)，這些突破性的發(fā)現(xiàn)填補(bǔ)了非編碼區(qū)在結(jié)直腸癌相關(guān)研究中的空白，將進(jìn)一步推動(dòng)對(duì)結(jié)直腸癌發(fā)病機(jī)制的理解。

論文作者、烏普薩拉大學(xué)的Tobias Sj?blom教授表示：“這項(xiàng)研究實(shí)現(xiàn)了迄今為止最大規(guī)模的結(jié)直腸癌基因組和轉(zhuǎn)錄組的綜合分析，并將分子層面的發(fā)現(xiàn)與高質(zhì)量的臨床數(shù)據(jù)相結(jié)合，從而識(shí)別關(guān)鍵預(yù)后因子，這使這項(xiàng)研究有別于其他絕大多數(shù)癌癥基因組學(xué)的研究。U-CAN大規(guī)模的臨床患者隊(duì)列與華大杰出的測(cè)序及數(shù)據(jù)分析能力相結(jié)合，對(duì)于本項(xiàng)目的成功至關(guān)重要，我們期待未來能在這一科學(xué)領(lǐng)域與華大持續(xù)合作。”

論文作者、華大基因智惠醫(yī)學(xué)研究院林從博士表示：“此次通過將華大先進(jìn)的基因組學(xué)技術(shù)和數(shù)據(jù)分析資源應(yīng)用于大規(guī)模結(jié)直腸癌人群，不僅發(fā)現(xiàn)多種突變事件對(duì)預(yù)后的顯著預(yù)測(cè)效應(yīng)，新構(gòu)建的表達(dá)譜精細(xì)分型也將在未來指導(dǎo)結(jié)直腸癌個(gè)體化診療中發(fā)揮重要作用。期望未來能更加系統(tǒng)深入地解析不同腫瘤的發(fā)生發(fā)展機(jī)制，利用華大前沿技術(shù)探索開發(fā)更具臨床應(yīng)用價(jià)值的標(biāo)志物，真正實(shí)現(xiàn)腫瘤的早診早治。”（俞洋）

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